Kairi é uma das sete Princesas de Coração. Ela residia em Hollow Bastion, mas um dia apareceu em Destiny Islands, tornando-se melhor amiga de Sora e Riku, apesar de não lembrar-se de nada sobre sua terra natal. Um dia, ela se separa de seus amigos, ao ter seu coração levado pelas trevas - entretando, o mesmo fica em posse de Sora, que a resgata no final.
Um ano depois, na esperança de se reencontrar com Roxas, Axel sequestra Kairi. Ele sabia que com ela, chegaria até Sora, e através dele, poderia encontrar Roxas novamente. Entretanto, Saïx tira Kairi de suas mãos e a trancafia no Castle That Never Was. Será Sora capaz de chegar até lá e resgatar sua amiga uma vez mais?