The Presence of Darkness (La Présence des Ténèbres) est le deuxième épisode de l'histoire de Kingdom Hearts: Dark Road, reprenant les missions 21 à 40. Il est disponible depuis le 30 juillet sur la version japonaise du jeu, et le 6 août 2020 sur sa version globale.
Xehanort se remémore l'époque où il vivait sur les Îles du Destin ; il ne s'était jamais demandé qui il était jusqu'au moment où il rencontra d'autres personnes : Ansem, puis ses camarades de la Classe inférieure de Scala ad Caelum.
A Scala, il passait des journées monotones, mais paisibles et confortables, avec les mêmes étudiants dans la même salle de classe. Malgré tout, sa vie à Scala ressemblait à son ancienne vie sur les Îles : une boucle sans fin. Il se demande si ce n'est pas plutôt les interactions avec d'autres cœurs qui façonnent l'identité d'un individu, ainsi que son avenir. La plus infime interaction peut altérer le cœur d'autrui, qu'il s'agisse de lumière ou de ténèbres.
Pays des Merveilles[]
Xehanort, Eraqus et leur compagnon attendent le reste de leurs camarades dans la forêt des lotus du Pays des Merveilles, ceux-ci étant fort en retard. Cependant, ce ne sont pas leurs camarades qui arrivent, mais le Chat de Cheshire, qui leur dit que leurs amis sont sous clé. Pour seul indice, le chat leur dit de rester sur place, et que la réponse viendrait à eux bien assez vite.
Des Cartes Soldats arrivent peu après, et tentent d'arrêter le groupe de Xehanort en tant qu'intrus au royaume de la Reine de Cœur. Avant qu'ils ne puissent le faire, cependant, une autre Carte arrive et les prévient qu'un procès est sur le point de commencer. Les Cartes s'en vont, abandonnant Xehanort. Puisque les Cartes Soldats avaient reconnu l'allure de Xehanort et ses compagnons, celui-ci en déduit qu'elles ont vu leurs amis. Eraqus en conclut, sur la base des dires du Chat de Cheshire, que leurs amis sont ceux dont le procès est sur le point de démarrer. Xehanort soupçonne ce monde d'avoir ses propres règles, ce qui explique que leurs camarades soient accusés d'un crime.
Quand ils arrivent à la cour de la Reine de Cœur, ce sont bien leurs camarades qui sont accusés d'avoir pénétré dans le domaine de la Reine, et semé le trouble. Tentant de se défendre, ils affirment qu'ils voulaient maintenir l'ordre en combattant les Sans-cœur, mais la Reine prend cela comme une offense encore plus grave à ses yeux, puisqu'ils ont bafoué ainsi son autorité : tous les habitants du Pays des Merveilles suivent l'autorité de la Reine, y compris les "monstres" qu'ils ont combattu.
Eraqus invoque sa Keyblade, prêt à arrêter ce procès. Xehanort lui rappelle qu'ils doivent obéir aux règles de ce monde, mais accepte malgré tout de se joindre à lui. Eraqus intervient dans le procès juste au moment où la Reine déclare les accusés coupables, levant une objection. Xehanort questionne le droit de la Reine de mener un procès seule, et Eraqus lui demande d'avoir pitié, et d'expliquer ce qu'ils ont fait de si terrible. Eraqus accuse la Reine de régner uniquement par la peur, mais la Reine refuse de le croire et ordonne leur exécution.
Les Cartes Soldat passent à l'attaque, mais avant que le combat ne s'engage, les Ténèbres de la Reine se manifestent comme une aura derrière elle, et un Sans-cœur apparaît, balayant les Cartes hors du chemin et affrontant à leur place les porteurs de Keyblade.
Une fois le Sans-cœur éliminé, les étudiants se rassemblent dans les bois. Eraqus pense qu'ils n'étaient en danger à aucun moment, mais Hermod n'est pas si sûr : même si les porteurs de Keyblade sont plus que capables de vaincre des Sans-cœur, ils ont fait face à une menace bien plus dangereuse : les Ténèbres dans le cœur d'une personne. Cependant, si le règne terrifiant de la Reine fait partie des règles de ce monde, Hermod n'est pas sûr qu'ils ont le droit, en tant qu'étrangers, de critiquer ce système.
Eraqus se demande si la Classe supérieure a fait face à un problème similaire. Bragi demande à Xehanort ce qu'il en pense, mais Xehanort était perdu dans ses propres pensées. Xehanort a une vision de Brain prévenant ses amis Ephemer, Skuld et Ventus que les Ténèbres peuvent se cacher n'importe où, même dans le cœur de quelqu'un, et se rappelle de l'aura de Ténèbres de la Reine de Cœur. Toutefois, quand il récite les mots de Brain, Eraqus les récite par cœur en même temps, et tous deux semblent surpris que l'autre connaisse ces mots. Puisque la Reine croit en son propre pouvoir et ne se rend pas compte de la peur qu'elle inspire ; cela pourrait forcer la main des porteurs de Keyblade à l'avenir.
Urd et Vor insistent qu'ils se concentrent sur leur mission et cherchent la Classe supérieure, de préférence sans d'autres détours. Eraqus prend toutefois Xehanort en aparté et lui demande si tout va bien. Xehanort s'interroge sur la possibilité que les Ténèbres s'enracinent si profondément dans un cœur que l'hôte ne s'en rende même pas compte, et demande à Eraqus s'il pourrait se servir de sa Keyblade contre un tel individu qui ignore ce qu'il est devenu. Eraqus décide qu'il va rester au Pays des Merveilles avec Xehanort, et un de leurs compagnons reste avec eux alors que les autres font déjà route vers le monde suivant pour continuer leur enquête.
Quatre ans plus tard : À la recherche de Ténèbres[]
Quatre ans plus tard, durant son voyage, Xehanort revient au Pays des Merveilles, et est arrêté par les Cartes Soldats et amené devant la Reine de Cœur pour un nouveau procès. Xehanort demande à la Reine si elle se souvient de lui, et immédiatement, son aura de Ténèbres fait à nouveau son apparition.